По части style guides по оформлению кода есть такая замечательная вещь, как стандарты: PSR-1, PSR-2 http://www.php-fig.org/psr/psr-2/ за которыми стоит много уважаемых людей и очень заметных проектов. Если говорить о личных предпочтениях, то мне больше всего нравились правила Codeigniter Style Guide http://kayitsorgu.ankara.edu.tr/user_guide/general/styleguide.html - но он, к сожалению, местами отличается от PSR-2.